Übersichtlichkeit und Reproduzierbarkeit während und nach dem Forschungsprojekt werden durch eine gute Organisation und Dokumentation der Forschungsdaten begünstigt.

Die Organisation von Forschungsdaten basiert insbesondere auf einem durchdachten Ablage- und Ordnersystem. Welche Daten, wo und unter welchem Namen abgelegt werden ist entscheidend für die Nachvollziehbarkeit der Forschungsergebnisse und die Nachnutzung der Forschungsdaten. Es ist zu empfehlen die Organisation ausreichend zu evaluieren und ein einmal gewähltes System beizubhalten.

Trotz klar strukturierter Organisation können Forschungsdaten für die Reproduzierbarkeit und Nachnutzung unbrauchbar sein, wenn sie nicht dokumentiert werden. Die Dokumentation der Forschungsdaten gibt Auskunft über die angewandte Forschungsmethode und das Vorgehen in Bezug auf die Erhebung, Beobachtung und Generierung der Forschungsdaten, sowie über deren Metadaten.